Die bajoranische Regierung ist die Nachfolgeorganisation der bajoranischen provisorischen Regierung.
2371 wird Shakaar Edon Premierminister der bajoranischen Regierung. Er löst dabei Kai Winn ab, die dieses Amt provisorisch ausübt und beinahe einen Bürgerkrieg auslöst. (DS9: Shakaar)
2373 heißt die bajoranische Regierung vertreten durch Major Kira das Dominion auf Deep Space 9 willkommen. (DS9: Zu den Waffen!)